Le 27 janvier 2023, Marielle Debos a soutenu son habilitation à diriger des recherches (HDR), intitulée « De la violence et des technologies de contrôle : Contribution à une sociologie politique du gouvernement ».
Actuellement, Marielle Debos co-dirige la thèse d’Héloïse Grard, Biométrie et identité dans les pays du Sud : la Banque mondiale au Kenya, avec Dominique Connan. Elle avait également co-dirigé la thèse de Kelma Manatouma, Identifier les individus au Tchad : Politiques et pratiques de l’état civil de 1960 à nos jours (soutenue en 2020) avec Pascale Laborier. Elle peut désormais diriger des thèses sans nécessairement passer par une co-direction.